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现阶段，超市进行农药残留检测主要还是采用农药残留检测仪，现阶段有了农残检测卡，减少了农产品农残检测的成本，但是并不能代替农药残留检测仪。
相比起农药残留检测仪，便携的农残检测卡检测的精度要更低，而且检测的过程太过简单，具有很多不确定性，检测的结果很难令消费者信服。而仪器采用酶抑制率原理，可以对农产品的农残抑制率进行检测，检测效率高，检测结果符合国家标准。
虽然农药残留检测仪在检测的成本上要比检测卡更高，但是在流程与检测精度上更加接近实验室标准，所以在超市、农贸市场、蔬菜集散基地等地依然以该仪器的使用为主。而农残检测卡的使用更多是满足个人以及家庭进行农产品检测的需求，其结果的准确性需要有专业的仪器或实验室进行进一步的确定。
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